Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TSPO2Q5TGU0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSPO2Q5TGU0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSPO2Q5TGU0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms