Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
RSPH4AQ5TD94 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RSPH4AQ5TD94 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms