Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP5B1Q2VPB7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms