Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1CQ13936 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms