Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTCH1Q13635 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTCH1Q13635 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTCH1Q13635 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
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