Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSPB3Q12988 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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