Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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GTF3C1Q12789 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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GTF3C1Q12789 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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GTF3C1Q12789 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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GTF3C1Q12789 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C1Q12789 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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