Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMTOR4Q0VGL1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMTOR4Q0VGL1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMTOR4Q0VGL1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms