Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F3Q08477 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms