Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC18A2Q05940 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms