Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 PUF3YLL013C 2640 nt5.35□□□□□ -1.55
YHC1Q05900 ACF2YLR144C 2340 nt5.35□□□□□ -1.55
YHC1Q05900 MKK2YPL140C 1521 nt5.35□□□□□ -1.55
YHC1Q05900 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.35□□□□□ -1.55
YHC1Q05900 TEL2YGR099W 2067 nt5.35□□□□□ -1.55
YHC1Q05900 GDA1YEL042W 1557 nt5.34□□□□□ -1.55
YHC1Q05900 SHM1YBR263W 1473 nt5.34□□□□□ -1.55
YHC1Q05900 YIR007WYIR007W 2295 nt5.34□□□□□ -1.55
YHC1Q05900 TRK2YKR050W 2670 nt5.34□□□□□ -1.55
YHC1Q05900 RIM101YHL027W 1878 nt5.34□□□□□ -1.55
YHC1Q05900 RFA1YAR007C 1866 nt5.34□□□□□ -1.55
YHC1Q05900 GPT2YKR067W 2232 nt5.33□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 SUB2YDL084W 1341 nt5.33□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 CLP1YOR250C 1338 nt5.33□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 PAN6YIL145C 930 nt5.33□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 YJL211CYJL211C 444 nt5.33□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 YKL223WYKL223W 333 nt5.33□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 GEP5YLR091W 882 nt5.33□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 MTQ1YNL063W 945 nt5.33□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 PDH1YPR002W 1551 nt5.33□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 UGO1YDR470C 1509 nt5.33□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 DBP9YLR276C 1785 nt5.32□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 UTP7YER082C 1665 nt5.32□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 MDH3YDL078C 1032 nt5.32□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 VCX1YDL128W 1236 nt5.32□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 HEM3YDL205C 984 nt5.32□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 HOR7YMR251W-A 180 nt5.32□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 UTP18YJL069C 1785 nt5.32□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 YDR154CYDR154C 351 nt5.31□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 TIF2YJL138C 1188 nt5.31□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 TIF1YKR059W 1188 nt5.31□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 YBL044WYBL044W 369 nt5.31□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 SNO4YMR322C 714 nt5.31□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 PGA2YNL149C 390 nt5.31□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 OST3YOR085W 1053 nt5.31□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 HSP33YOR391C 714 nt5.31□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 HSP32YPL280W 714 nt5.31□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 RAT1YOR048C 3021 nt5.31□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 PCS60YBR222C 1632 nt5.3□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 MED6YHR058C 888 nt5.3□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 PGA3YML125C 939 nt5.3□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 UIP4YPL186C 915 nt5.3□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 HXT3YDR345C 1704 nt5.3□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 HFI1YPL254W 1467 nt5.3□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 TEF1YPR080W 1377 nt5.29□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 TEF2YBR118W 1377 nt5.29□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 SHE10YGL228W 1734 nt5.29□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 YDL144CYDL144C 1071 nt5.29□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 YPL102CYPL102C 303 nt5.29□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 RNR3YIL066C 2610 nt5.28□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 CHS5YLR330W 2016 nt5.28□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 MTQ2YDR140W 666 nt5.28□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 SHP1YBL058W 1272 nt5.28□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 ATP4YPL078C 735 nt5.28□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 YFL034WYFL034W 3222 nt5.28□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 EEB1YPL095C 1371 nt5.28□□□□□ -1.56
YHC1Q05900 CST6YIL036W 1764 nt5.27□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 YDR053WYDR053W 396 nt5.27□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 ORM1YGR038W 669 nt5.27□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 YKL031WYKL031W 414 nt5.27□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 YNR048WYNR048W 1182 nt5.27□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 CWC27YPL064C 906 nt5.27□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 ACC1YNR016C 6702 nt5.27□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 HXT17YNR072W 1695 nt5.27□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 GLO2YDR272W 825 nt5.26□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 CWC21YDR482C 408 nt5.26□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 YDR541CYDR541C 1035 nt5.26□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 CDC43YGL155W 1131 nt5.26□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 LST8YNL006W 912 nt5.26□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 ALT1YLR089C 1779 nt5.26□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 YEL077CYEL077C 3834 nt5.26□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 HPF1YOL155C 2904 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 SWP1YMR149W 861 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 CPA1YOR303W 1236 nt5.25□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 DED81YHR019C 1665 nt5.24□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 PDC1YLR044C 1692 nt5.24□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 ROG3YFR022W 2202 nt5.24□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 OPT1YJL212C 2400 nt5.24□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 JIP4YDR475C 2631 nt5.24□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 MND2YIR025W 1107 nt5.24□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 UBC4YBR082C 447 nt5.24□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 ARR3YPR201W 1215 nt5.24□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 SPS22YCL048W 1392 nt5.24□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 NPL6YMR091C 1308 nt5.23□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 RPT1YKL145W 1404 nt5.23□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 TFC6YDR362C 2019 nt5.23□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 PIN2YOR104W 849 nt5.23□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 HST2YPL015C 1074 nt5.23□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 NSE5YML023C 1671 nt5.23□□□□□ -1.57
YHC1Q05900 OXP1YKL215C 3861 nt5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.3 ms