Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFI35P80217 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IFI35P80217 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFI35P80217 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFI35P80217 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFI35P80217 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFI35P80217 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFI35P80217 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFI35P80217 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFI35P80217 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFI35P80217 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFI35P80217 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFI35P80217 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFI35P80217 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFI35P80217 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFI35P80217 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFI35P80217 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFI35P80217 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFI35P80217 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFI35P80217 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFI35P80217 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFI35P80217 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFI35P80217 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFI35P80217 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFI35P80217 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFI35P80217 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFI35P80217 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFI35P80217 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFI35P80217 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFI35P80217 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFI35P80217 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFI35P80217 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFI35P80217 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFI35P80217 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFI35P80217 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFI35P80217 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFI35P80217 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFI35P80217 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFI35P80217 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFI35P80217 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFI35P80217 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFI35P80217 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFI35P80217 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFI35P80217 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFI35P80217 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
IFI35P80217 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFI35P80217 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFI35P80217 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFI35P80217 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFI35P80217 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFI35P80217 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFI35P80217 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFI35P80217 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFI35P80217 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFI35P80217 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFI35P80217 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFI35P80217 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFI35P80217 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFI35P80217 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFI35P80217 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFI35P80217 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFI35P80217 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IFI35P80217 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFI35P80217 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFI35P80217 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFI35P80217 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFI35P80217 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFI35P80217 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFI35P80217 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFI35P80217 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFI35P80217 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFI35P80217 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFI35P80217 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFI35P80217 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFI35P80217 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFI35P80217 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IFI35P80217 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFI35P80217 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFI35P80217 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFI35P80217 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFI35P80217 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFI35P80217 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFI35P80217 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFI35P80217 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFI35P80217 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFI35P80217 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFI35P80217 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFI35P80217 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms