Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB1P62873 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB1P62873 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB1P62873 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB1P62873 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB1P62873 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB1P62873 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB1P62873 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB1P62873 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GNB1P62873 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GNB1P62873 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GNB1P62873 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GNB1P62873 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GNB1P62873 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GNB1P62873 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GNB1P62873 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB1P62873 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB1P62873 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB1P62873 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB1P62873 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB1P62873 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB1P62873 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB1P62873 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB1P62873 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB1P62873 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB1P62873 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB1P62873 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB1P62873 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB1P62873 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB1P62873 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB1P62873 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB1P62873 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB1P62873 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB1P62873 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB1P62873 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB1P62873 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB1P62873 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB1P62873 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB1P62873 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB1P62873 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB1P62873 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB1P62873 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB1P62873 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB1P62873 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB1P62873 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB1P62873 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB1P62873 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB1P62873 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB1P62873 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB1P62873 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB1P62873 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB1P62873 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB1P62873 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB1P62873 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB1P62873 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB1P62873 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB1P62873 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB1P62873 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB1P62873 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB1P62873 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB1P62873 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB1P62873 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB1P62873 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB1P62873 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB1P62873 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB1P62873 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB1P62873 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB1P62873 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB1P62873 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB1P62873 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GNB1P62873 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GNB1P62873 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GNB1P62873 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GNB1P62873 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GNB1P62873 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GNB1P62873 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB1P62873 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB1P62873 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB1P62873 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB1P62873 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB1P62873 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB1P62873 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB1P62873 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB1P62873 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms