Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE2HP62256 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE2HP62256 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms