Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCE1P61221 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCE1P61221 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms