Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42P60953 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42P60953 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42P60953 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42P60953 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42P60953 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42P60953 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42P60953 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42P60953 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42P60953 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42P60953 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42P60953 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42P60953 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42P60953 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42P60953 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42P60953 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42P60953 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42P60953 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42P60953 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42P60953 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42P60953 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42P60953 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42P60953 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42P60953 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42P60953 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42P60953 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42P60953 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42P60953 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42P60953 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42P60953 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42P60953 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42P60953 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42P60953 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42P60953 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42P60953 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42P60953 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42P60953 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42P60953 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42P60953 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42P60953 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42P60953 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42P60953 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42P60953 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42P60953 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42P60953 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42P60953 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42P60953 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42P60953 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42P60953 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42P60953 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42P60953 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42P60953 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42P60953 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42P60953 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42P60953 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42P60953 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42P60953 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42P60953 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42P60953 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42P60953 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42P60953 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42P60953 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42P60953 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42P60953 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42P60953 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42P60953 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42P60953 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42P60953 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42P60953 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42P60953 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42P60953 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42P60953 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42P60953 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42P60953 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42P60953 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42P60953 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42P60953 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42P60953 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42P60953 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42P60953 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42P60953 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42P60953 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42P60953 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42P60953 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42P60953 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42P60953 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42P60953 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42P60953 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42P60953 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42P60953 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42P60953 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42P60953 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42P60953 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42P60953 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42P60953 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42P60953 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42P60953 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42P60953 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42P60953 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42P60953 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms