Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2BFSP57053 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2BFSP57053 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.4 ms