Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BGRP55822 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BGRP55822 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.3 ms