Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
AP2S1P53680 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1255.9 ms