Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ITGAEP38570 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ITGAEP38570 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ITGAEP38570 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms