Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCD1P33897 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms