Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A4P31645 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A4P31645 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms