Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3P19429 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms