Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
KCNA6P17658 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
KCNA6P17658 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNA6P17658 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KCNA6P17658 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms