Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ITGB4P16144 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ITGB4P16144 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms