Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIP12755 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIP12755 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIP12755 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIP12755 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIP12755 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIP12755 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIP12755 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIP12755 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIP12755 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIP12755 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIP12755 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIP12755 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIP12755 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIP12755 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIP12755 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SKIP12755 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIP12755 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIP12755 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIP12755 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIP12755 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIP12755 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIP12755 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIP12755 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIP12755 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIP12755 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIP12755 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIP12755 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIP12755 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIP12755 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIP12755 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIP12755 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIP12755 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIP12755 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIP12755 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIP12755 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIP12755 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIP12755 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIP12755 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIP12755 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIP12755 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIP12755 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIP12755 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIP12755 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIP12755 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIP12755 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIP12755 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIP12755 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIP12755 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIP12755 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIP12755 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIP12755 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIP12755 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIP12755 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIP12755 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIP12755 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIP12755 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKIP12755 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKIP12755 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SKIP12755 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SKIP12755 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SKIP12755 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIP12755 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIP12755 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIP12755 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIP12755 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIP12755 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIP12755 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIP12755 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIP12755 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIP12755 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIP12755 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIP12755 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIP12755 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIP12755 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIP12755 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIP12755 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIP12755 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIP12755 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIP12755 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIP12755 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIP12755 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKIP12755 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKIP12755 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIP12755 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIP12755 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIP12755 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms