Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAMP11215 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAMP11215 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms