Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMIM10L2BP0DMW5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM10L2BP0DMW5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMIM10L2BP0DMW5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMIM10L2BP0DMW5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM10L2BP0DMW5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM10L2BP0DMW5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM10L2BP0DMW5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms