Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00271P0C7V0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00271P0C7V0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms