Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTXN2P0C2S0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN2P0C2S0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms