Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP1P09874 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP1P09874 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP1P09874 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PARP1P09874 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARP1P09874 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PARP1P09874 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PARP1P09874 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP1P09874 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP1P09874 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP1P09874 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP1P09874 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP1P09874 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP1P09874 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP1P09874 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP1P09874 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP1P09874 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP1P09874 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP1P09874 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP1P09874 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP1P09874 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP1P09874 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP1P09874 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP1P09874 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP1P09874 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP1P09874 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP1P09874 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP1P09874 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP1P09874 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP1P09874 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP1P09874 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP1P09874 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP1P09874 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP1P09874 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP1P09874 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP1P09874 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP1P09874 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP1P09874 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP1P09874 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP1P09874 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP1P09874 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP1P09874 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP1P09874 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP1P09874 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP1P09874 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP1P09874 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP1P09874 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP1P09874 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP1P09874 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PARP1P09874 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARP1P09874 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP1P09874 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP1P09874 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP1P09874 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP1P09874 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP1P09874 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP1P09874 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP1P09874 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP1P09874 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP1P09874 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP1P09874 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP1P09874 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP1P09874 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP1P09874 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP1P09874 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP1P09874 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP1P09874 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP1P09874 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP1P09874 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP1P09874 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP1P09874 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP1P09874 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP1P09874 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP1P09874 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP1P09874 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP1P09874 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP1P09874 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP1P09874 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP1P09874 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP1P09874 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP1P09874 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP1P09874 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP1P09874 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP1P09874 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP1P09874 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP1P09874 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP1P09874 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP1P09874 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP1P09874 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP1P09874 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP1P09874 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP1P09874 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP1P09874 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP1P09874 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP1P09874 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP1P09874 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP1P09874 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP1P09874 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP1P09874 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP1P09874 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms