Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSLP07711 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSLP07711 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSLP07711 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSLP07711 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSLP07711 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSLP07711 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSLP07711 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSLP07711 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSLP07711 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSLP07711 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSLP07711 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSLP07711 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSLP07711 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSLP07711 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSLP07711 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSLP07711 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSLP07711 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTSLP07711 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSLP07711 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSLP07711 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSLP07711 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSLP07711 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSLP07711 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSLP07711 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSLP07711 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSLP07711 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSLP07711 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSLP07711 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSLP07711 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSLP07711 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSLP07711 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSLP07711 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSLP07711 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSLP07711 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSLP07711 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSLP07711 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSLP07711 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSLP07711 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSLP07711 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSLP07711 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSLP07711 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSLP07711 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSLP07711 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSLP07711 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSLP07711 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSLP07711 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSLP07711 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSLP07711 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSLP07711 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSLP07711 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSLP07711 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSLP07711 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSLP07711 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSLP07711 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSLP07711 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSLP07711 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSLP07711 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSLP07711 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSLP07711 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSLP07711 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSLP07711 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSLP07711 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSLP07711 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSLP07711 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSLP07711 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSLP07711 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSLP07711 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSLP07711 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSLP07711 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSLP07711 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSLP07711 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSLP07711 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSLP07711 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSLP07711 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSLP07711 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSLP07711 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSLP07711 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSLP07711 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSLP07711 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSLP07711 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSLP07711 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSLP07711 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSLP07711 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSLP07711 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSLP07711 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSLP07711 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSLP07711 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSLP07711 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSLP07711 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSLP07711 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSLP07711 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSLP07711 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSLP07711 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSLP07711 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSLP07711 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSLP07711 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSLP07711 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSLP07711 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSLP07711 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms