Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HLA-DOAP06340 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HLA-DOAP06340 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms