Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1P04632 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1P04632 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.8 ms