Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP3BO95985 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms