Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
S1PR4O95977 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
S1PR4O95977 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms