Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX3O95343 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX3O95343 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX3O95343 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIX3O95343 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIX3O95343 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIX3O95343 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIX3O95343 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX3O95343 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX3O95343 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX3O95343 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX3O95343 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX3O95343 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX3O95343 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX3O95343 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX3O95343 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX3O95343 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX3O95343 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX3O95343 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX3O95343 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX3O95343 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX3O95343 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX3O95343 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX3O95343 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIX3O95343 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIX3O95343 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIX3O95343 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIX3O95343 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIX3O95343 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIX3O95343 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIX3O95343 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX3O95343 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX3O95343 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX3O95343 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX3O95343 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX3O95343 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX3O95343 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX3O95343 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX3O95343 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX3O95343 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX3O95343 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX3O95343 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX3O95343 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX3O95343 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX3O95343 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX3O95343 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX3O95343 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX3O95343 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX3O95343 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX3O95343 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIX3O95343 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIX3O95343 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIX3O95343 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIX3O95343 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIX3O95343 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX3O95343 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX3O95343 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX3O95343 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX3O95343 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX3O95343 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX3O95343 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX3O95343 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX3O95343 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX3O95343 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX3O95343 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX3O95343 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX3O95343 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX3O95343 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX3O95343 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX3O95343 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX3O95343 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX3O95343 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX3O95343 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX3O95343 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX3O95343 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SIX3O95343 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX3O95343 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX3O95343 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX3O95343 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX3O95343 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX3O95343 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX3O95343 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX3O95343 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX3O95343 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX3O95343 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX3O95343 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX3O95343 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX3O95343 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms