Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MBD4O95243 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MBD4O95243 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MBD4O95243 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MBD4O95243 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MBD4O95243 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MBD4O95243 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MBD4O95243 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MBD4O95243 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MBD4O95243 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MBD4O95243 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MBD4O95243 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MBD4O95243 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MBD4O95243 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MBD4O95243 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MBD4O95243 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MBD4O95243 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MBD4O95243 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MBD4O95243 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MBD4O95243 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD4O95243 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD4O95243 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD4O95243 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD4O95243 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD4O95243 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD4O95243 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD4O95243 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD4O95243 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD4O95243 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD4O95243 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD4O95243 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD4O95243 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD4O95243 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD4O95243 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD4O95243 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD4O95243 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD4O95243 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD4O95243 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD4O95243 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD4O95243 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD4O95243 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD4O95243 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD4O95243 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD4O95243 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD4O95243 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD4O95243 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD4O95243 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD4O95243 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD4O95243 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD4O95243 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD4O95243 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD4O95243 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD4O95243 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MBD4O95243 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MBD4O95243 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MBD4O95243 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MBD4O95243 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MBD4O95243 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MBD4O95243 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MBD4O95243 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MBD4O95243 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MBD4O95243 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MBD4O95243 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD4O95243 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD4O95243 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD4O95243 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD4O95243 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD4O95243 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD4O95243 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD4O95243 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD4O95243 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD4O95243 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MBD4O95243 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MBD4O95243 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MBD4O95243 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MBD4O95243 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MBD4O95243 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MBD4O95243 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MBD4O95243 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MBD4O95243 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MBD4O95243 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MBD4O95243 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MBD4O95243 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MBD4O95243 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD4O95243 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD4O95243 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD4O95243 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD4O95243 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MBD4O95243 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD4O95243 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD4O95243 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD4O95243 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD4O95243 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD4O95243 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD4O95243 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD4O95243 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD4O95243 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD4O95243 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD4O95243 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD4O95243 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms