Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOL3O95236 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOL3O95236 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOL3O95236 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOL3O95236 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOL3O95236 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOL3O95236 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOL3O95236 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOL3O95236 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOL3O95236 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOL3O95236 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOL3O95236 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOL3O95236 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOL3O95236 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOL3O95236 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOL3O95236 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOL3O95236 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOL3O95236 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOL3O95236 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOL3O95236 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOL3O95236 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOL3O95236 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOL3O95236 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOL3O95236 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOL3O95236 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOL3O95236 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOL3O95236 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOL3O95236 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOL3O95236 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOL3O95236 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOL3O95236 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOL3O95236 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOL3O95236 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOL3O95236 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOL3O95236 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOL3O95236 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOL3O95236 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOL3O95236 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL3O95236 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL3O95236 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL3O95236 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL3O95236 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL3O95236 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL3O95236 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL3O95236 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL3O95236 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL3O95236 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL3O95236 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL3O95236 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL3O95236 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL3O95236 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL3O95236 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL3O95236 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL3O95236 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL3O95236 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL3O95236 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL3O95236 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL3O95236 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL3O95236 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms