Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGSF3O75054 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IGSF3O75054 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms