Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMAD6O43541 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.2 ms