Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC1O15269 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTLC1O15269 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms