Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QQQ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QQQ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QQQ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QQQ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QQQ9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QQQ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QQQ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QQQ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QQQ9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QQQ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QQQ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QQQ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QQQ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QQQ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QQQ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QQQ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QQQ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QQQ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QQQ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QQQ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QQQ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
J3QQQ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms