Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BHMG1C9JSJ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms