Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF3CLB5ME19 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3CLB5ME19 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CLB5ME19 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CLB5ME19 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CLB5ME19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CLB5ME19 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CLB5ME19 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CLB5ME19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CLB5ME19 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms