Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBY3A6NI87 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms