Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRABD2BA6NFA1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRABD2BA6NFA1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms