Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB2Q9Y5G2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHGB2Q9Y5G2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHGB2Q9Y5G2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms