Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPC6Q9Y210 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPC6Q9Y210 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPC6Q9Y210 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms