Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms